Agarosa y poliacrilamida
Existen varias diferencias relacionadas con la agarosa y la poliacrilamida, incluida su estructura física, toxicidad y sus métodos de vertido, así como su precio. Es útil conocer estas diferencias, así como sus similitudes, si se trata de alguno de estos tipos de geles.
Una de las principales diferencias entre estos dos geles es que la agarosa se vierte horizontalmente, mientras que la poliacrilamida se vierte verticalmente. Es mucho más fácil verter agarosa de esta manera horizontal. La agarosa se puede calentar para ayudar en el proceso de vertido, sin embargo, no se debe calentar a un grado tan extenso que la agarosa termine derritiéndose. También se puede decidir si usar carriles angostos o anchos para verter la agarosa. Se puede verter utilizando este método de ranurado, y esta es una de sus ventajas. Mientras se vierte, se debe tener mucho cuidado, ya que la agarosa es muy delicada y se puede romper fácilmente.
Por otro lado, como se mencionó, la poliacrilamida se vierte verticalmente. La poliacrilamida necesita placas de vidrio para ayudar con este proceso, ya que su estructura es muy delgada y este soporte adicional es necesario. A diferencia de la agarosa, la poliacrilamida no puede recalentarse y luego verterse.
La agarosa consta de muchas moléculas, mientras que la poliacrilamida generalmente consiste en una sola molécula grande. Las moléculas de agarosa se mantienen unidas por fuerzas intermoleculares, y las moléculas se componen de ADN. Hay moléculas grandes y pequeñas, y en general, las moléculas más grandes se separan más fácilmente que las más pequeñas. La molécula de poliacrilamida está formada por ADN o proteína. Los espacios entre los geles de poliacrilamida son más pequeños que los de los geles de agarosa, que es otra diferencia entre estas dos sustancias. Cuando el tamaño de las bandas es el mismo en agarosa, hay varios tamaños de banda en poliacrilamida. Si la molécula de poliacrilamida se expone al aire, no se solidificará de manera uniforme, ya que el aire sujeta el proceso de polimerización.
En cuanto a la toxicidad, la agarosa se considera una sustancia no tóxica. Si bien se considera que la poliacrilamida es la misma, se considera que su polvo es tóxico, y es prudente incluso manejar los geles con medidas de protección.
La poliacrilamida se utiliza para la secuenciación de geles y geles de proteínas. Sus ventajas son que tiene propiedades de fácil tinción y se puede secar para formar un gel. Se compra pre vertido y es menos costoso que la agarosa, a unos $ 5''7 por gel. (La agarosa es de alrededor de $ 1 por gramo). Se recomienda que una persona tenga experiencia suficiente antes de comprar cualquiera de estos dos geles, ya que con frecuencia, el número de muestras requerido y la concentración del gel necesario, deben ser conocidos antes de cualquier compra.
Resumen:
1. La agarosa se vierte horizontalmente, mientras que la poliacrilamida se vierte verticalmente. 2. La agarosa es más cara que la poliacrilamida. 3. La agarosa consta de muchas moléculas, mientras que la poliacrilamida consta de una sola molécula grande. 4. A diferencia de la poliacrilamida, la agarosa puede recalentarse. 5. La agarosa se considera una sustancia no tóxica en todas sus formas, mientras que el polvo de poliacrilamida se determina que es tóxico.
